Устранение ошибок в работе системы автоматизации, выявленных в процессе ее эксплуатации, осуществляется путем выпуска обновлений, патчей и дополнений к системе. Обновления, патчи и дополнения могут также оказывать негативное влияние на эффективность работы системы, как и устаревшее программное обеспечение: специалисты, работающие над созданием доработок, не застрахованы от совершения ошибок, особенно в случае, если у них недостаточно релевантного опыта.